Auf der körperlichen Ebene vermag Atemtherapie die Selbstheilungskräfte zu mobilisieren und fördert dadurch die Gesundheit. Atemtherapie wird als zusätzliche Maßnahme, z. B. bei folgenden Erkrankungen und funktionellen Störungen empfohlen:

- chronische Lungenerkrankungen wie Asthma bronchiale, chronische Bronchitis,  sowie funktionelle Störungen der Lunge
- Funktionelle Störungen des Herz- und Kreislaufsystems
- Degenerative und funktionelle Störungen des Bewegungsapparates
- Erschöpfungs- und Spannungszustände
- Migräne
- Funktionelle Störungen des Verdauungstraktes

Auf der psychologischen Ebene stärkt Atemtherapie die Persönlichkeit und das Selbstbewußtsein und fördert einen Entwicklungsweg zum eigenen inneren Wesen. Man kommt mit sich selbst ins Gespräch und stellt eine Verbindung zu sich selbst her. Man lernt sich in seiner Art anzunehmen. Dadurch wird man befähigt, neue Kommunikationswege zu sich selbst und anderen aufzubauen.